Protein–RNA interactions for Protein: Q8CA72

Gan, Gigaxonin, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GanQ8CA72 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GanQ8CA72 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GanQ8CA72 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GanQ8CA72 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms