Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms