Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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4933409G03RikQ8C5U0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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4933409G03RikQ8C5U0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933409G03RikQ8C5U0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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4933409G03RikQ8C5U0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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