Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FarsaQ8C0C7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FarsaQ8C0C7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FarsaQ8C0C7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms