Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp47Q8BY87 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp47Q8BY87 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms