Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp5Q8BX09 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms