Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp38Q8BW70 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms