Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN4

Mterf4, Transcription termination factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf4Q8BVN4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mterf4Q8BVN4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mterf4Q8BVN4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms