Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod1Q8BVA4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod1Q8BVA4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms