Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp398Q8BV16 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp398Q8BV16 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms