Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nup54Q8BTS4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nup54Q8BTS4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup54Q8BTS4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms