Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cep55Q8BT07 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep55Q8BT07 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms