Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
5730596B20RikQ8BQ08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms