Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcaf1Q8BNE1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
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Tcaf1Q8BNE1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Tcaf1Q8BNE1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcaf1Q8BNE1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Tcaf1Q8BNE1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms