Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga3Q8BMI3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga3Q8BMI3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms