Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Me3Q8BMF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Me3Q8BMF3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Me3Q8BMF3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Me3Q8BMF3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.2 ms