Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Usp54Q8BL06 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Usp54Q8BL06 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms