Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc2Q8BKV1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc2Q8BKV1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc2Q8BKV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms