Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcfc2Q8BKT3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcfc2Q8BKT3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms