Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKF1

Polrmt, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolrmtQ8BKF1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PolrmtQ8BKF1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PolrmtQ8BKF1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms