Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy1Q8BIJ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy1Q8BIJ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy1Q8BIJ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy1Q8BIJ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy1Q8BIJ7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rufy1Q8BIJ7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rufy1Q8BIJ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rufy1Q8BIJ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rufy1Q8BIJ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy1Q8BIJ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms