Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe23Q8BGW3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms