Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vipas39Q8BGQ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Vipas39Q8BGQ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Vipas39Q8BGQ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vipas39Q8BGQ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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