Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pknox2Q8BG99 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pknox2Q8BG99 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms