Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ctdspl2Q8BG15 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctdspl2Q8BG15 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctdspl2Q8BG15 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms