Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnpo1Q8BFY9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnpo1Q8BFY9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms