Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc17a8Q8BFU8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc17a8Q8BFU8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a8Q8BFU8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms