Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Liat1Q810M6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Liat1Q810M6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Liat1Q810M6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms