Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Smim19Q80ZU4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim19Q80ZU4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Smim19Q80ZU4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Smim19Q80ZU4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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