Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ClspnQ80YR7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ClspnQ80YR7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ClspnQ80YR7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms