Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Lca5Q80ST9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lca5Q80ST9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms