Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna12Q80SS5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna12Q80SS5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms