Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Lamp3Q7TST5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lamp3Q7TST5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms