Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctdp1Q7TSG2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdp1Q7TSG2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms