Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf18Q7TS55 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms