Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ShprhQ7TPQ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ShprhQ7TPQ3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ShprhQ7TPQ3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ShprhQ7TPQ3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms