Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp397Q7TNK4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp397Q7TNK4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms