Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdcl2Q78Y63 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl2Q78Y63 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms