Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TwistnbQ78WZ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TwistnbQ78WZ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms