Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snd1Q78PY7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snd1Q78PY7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snd1Q78PY7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms