Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssh1Q76I79 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh1Q76I79 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms