Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sned1Q70E20 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sned1Q70E20 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sned1Q70E20 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms