Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Syne2Q6ZWQ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Syne2Q6ZWQ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms