Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Topbp1Q6ZQF0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms