Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Igsf3Q6ZQA6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf3Q6ZQA6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms