Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp34Q6ZQ93 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp34Q6ZQ93 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp34Q6ZQ93 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms