Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Glis3Q6XP49 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Glis3Q6XP49 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Glis3Q6XP49 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Glis3Q6XP49 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Glis3Q6XP49 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Glis3Q6XP49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Glis3Q6XP49 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Glis3Q6XP49 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Glis3Q6XP49 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms