Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcl3Q6W5C0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcl3Q6W5C0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcl3Q6W5C0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms