Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc88cQ6VGS5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc88cQ6VGS5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms