Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clca4aQ6Q473 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clca4aQ6Q473 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clca4aQ6Q473 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms